Farmasötik Mikrobiyoloji Doktora Programı

Farmasötik Mikrobiyoloji doktora programı Yükseköğretim Kurulu Başkanlığı’nın 22/08/2013 tarih ve 75850160.104.01.04.6213/45369 sayılı yazısında yer alan Yükseköğretim genel kurul kararı ile açılmıştır.
Farmasötik Mikrobiyoloji, insanlarda enfeksiyona neden olan mikroorganizmaların özelliklerini, bu mikroorganizmaların neden olduğu hastalıkları ve bu hastalıkların tanısında kullanılan mikrobiyolojik yöntemleri inceler. Ayrıca antimikrobiyal ajanlar ve mikrobiyal kaynaklı ürünlerin üretimi, kozmetik ve farmasötiklerde mikrobiyolojik kalite kontrol prosedürleri, sterilizasyon-dezenfeksiyon yöntemleri ve genel hijyen gibi konular da Farmasotik Mikrobiyoloji’nin ilgi alanına girer. Anabilim dalımız interdisipliner bir bilim dalı olan Farmasötik Mikrobiyoloji alanındaki temel kavramları özümsemiş ve bunları mesleğin her alanında uygulama yeteneğine sahip olan eczacılar, temel bilimciler ve araştırmacılar yetiştirmeyi amaç edinmiştir. Bunun yanı sıra, Anabilim Dalımız, Farmasötik Mikrobiyoloji ve Tıbbi Mikrobiyoloji alanındaki gelişmeleri yakından takip ederek toplum sağlığına hizmet eden güncel araştırmalar yapmayı ve edindiği bilgi birikimini ulusal ve uluslararası platformda öğrencilere, bilim dünyasına, endüstriye ve topluma en etkin şekilde aktarmayı hedeflemektedir.
Anabilim Dalı’nın Doktora programında mevcut olan derslerden en az 21 kredilik (120 AKTS karşılığı) ders alan ve tümünü başarıyla tamamlayan, 4.00 üzerinden en az 3.50 ağırlıklı not ortalaması elde eden ve konusuyla ilgili bir alanda hazırladığı ve seçilmiş bir jüri tarafından başarılı sayılan bir tezi başarıyla savunan öğrencilere FARMASÖTİK MİKROBİYOLOJİ alanında Doktora diploması verilir.Yüksek lisans derecesi ile doktora programlarına başvuran adayın; 1- Lisans ve yüksek lisans diplomasına sahip olması, 2- Akademik Personel ve Lisansüstü Eğitim Giriş Sınavı (ALES)’nın ilgili alanından geçerli puanı almış olması, 3- Üniversitelerarası Kurul tarafından kabul edilen dil sınavlarının birinden Üniversitelerarası Kurul tarafından belirlenen başarı puanına sahip olması, 4- Anabilim Dalı tarafından yapılan mülakattan başarılı olması gerekir. Lisans derecesi ile doktora programlarına başvuran adayın; 1- Lisans mezuniyet not ortalamasının 100 üzerinden en az 85.00 veya eşdeğeri olması, 2- ALES’in ilgili alanından en az 90 puan almış olması, 3- Üniversitelerarası Kurul tarafından kabul edilen dil sınavlarının birinden “Üniversitelerarası Kurul” tarafından belirlenen başarı puanına sahip olması, 4-Anabilim dalı tarafından yapılan mülakattan başarılı olması gerekir. Doktora programına yüksek lisans derecesi ile başlayan öğrenciler içinyeterlilik koşulları; 1- Anabilim Dalının ya da ilişkili olan diğer Anabilim Dallarının lisansüstü programlarında mevcut olan derslerden en az 21 kredilik (120 AKTS) ders ve en az 1 seminer dersini alıp, başarılı (100 üzerinden en az 80 puan) olmak, 2- Doktora yeterlik sınavından başarılı olmak, 3- Konusuyla ilgili bir alanda hazırladığı tezi (120 AKTS) jüri önünde savunarak başarılı olmak. Doktora programına lisans derecesi ile başlayan öğrenciler için; 1-Anabilim Dalının ya da ilişkili olan diğer Anabilim Dallarının lisansüstü programlarında mevcut olan derslerden en az 42 kredilik (150 AKTS) ders ve en az 1 seminer dersini alıp, başarılı (100 üzerinden en az 80 puan) olmak, 2- Doktora yeterlik sınavından başarılı olmak, 3- Konusu ile ilgili bir alanda hazırladığı tezi (150 AKTS) jüri önünde savunarak başarılı olmak. Doktora eğitimini başarı ile tamamlayanlar, ilgili üniversitenin ‘’Öğretim Üyesi Atama ve Yükseltme Kriterleri’’ni sağlamak koşuluyla öğretim üyesi olarak atanmak suretiyle akademik kariyer yapabilirler. Ayrıca doktora sonrası programlara (post-doc) başvurabilirler.
Mezunlarımız ilaç ve kozmetik endüstrisinde kalite kontrol laboratuvarlarında, il kontrol laboratuvarlarında, araştırma merkezlerinde çalışma imkanı bulabilmektedirler.
Son İki Yılda Uluslararası Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2025
36. Oğultekin teneke, S.; Serin, M.; öksüz, Z.; Temel, G.; Yaraş, S.; üçbilek, E.; Sezgin, O. Circulating chemokine levels and receptor polymorphisms have potential as biomarkers for fibrosis stages in patients with chronic hepatitis C infection. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2025, 52, 12-.
10.1007/s11033-025-10244-5
2025
35. Alterkaoui, A.; Gonca, S.; Doğan, S.; ışık, Z.; özdemir, S.; Filiz, V.; Dizge, N. Preparation of Cobalt Oxide Powders Synthesized by Green Chemistry Method and Improving the Antibacterial Performance of PES Membrane. WATER, AIR, & SOIL POLLUTION, 2025, 236, -.
10.1007/s11270-025-07796-4
2024
34. Giray, G.; Gonca, S.; özdemir, S.; ışık, Z.; Yılmaz, E.; Soylak, M.; Dizge, N. Novel extracellular synthesized silver nanoparticles using thermophilic Anoxybacillus flavithermus and Geobacillus stearothermophilus and their evaluation as nanodrugs. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, 2024, 54, 294-306.
10.1080/10826068.2023.2230496
33. ülger, M. Design, synthesis, biological evaluation and docking analysis of pyrrolidine-benzenesulfonamides as carbonic anhydrase or acetylcholinesterase inhibitors and antimicrobial agents. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2024, 42, 3441-3458.
10.1080/07391102.2023.2214224
32. Aktaş, D.; Kaplan, E.; Ergin, .; Ilkit, M.; Döğen, A. Çevresel Örneklerde Cryptococcus Kolonizasyonunun ve Eşey Genotipinin Araştırılması. MIKROBIYOLOJI BÜLTENI, 2024, 58, 39-48.
10.5578/mb.20249904
31. ödemiş, .; özdemir, S.; Gonca, S.; Ağırtaş, M. Characterization of silver nanoparticles fabricated by green synthesis using Urtica dioica and Lavandula angustifolia and investigation of antimicrobial and antioxidant. INORGANIC AND NANO-METAL CHEMISTRY, 2024, 54, 429-442.
10.1080/24701556.2022.2068584
30. Koçak, Y.; Aygün, A.; Altuner, E.; özdemir, S.; Gonca, S.; Berikten, D.; Tiri, R.; şen, F. Eco-friendly production of platinum nanoparticles: physicochemical properties, evaluation of biological and catalytic activities. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2024, 21, 51-62.
10.1007/s13762-023-05232-w
29. Tiri, R.; Aygun, A.; Bekmezci, M.; Gonca, S.; özdemir, S.; Kaymak, G.; Karimi‑maleh, H.; şen, F. Environmental Energy Production and Wastewater Treatment Using Synthesized Pd Nanoparticles with Biological and Photocatalytic Activity. TOPICS IN CATALYSIS, 2024, 67, -.
10.1007/s11244-024-01912-0
28. Binzet, G.; Turunç, E.; Binzet, R.; Döğen, A.; Arslan, H. Chemical composition and antimicrobial activity of essential oils and various extracts of endemic Onosma malatyana (Boraginaceae) from Anatolia. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL HEALTH RESEARCH, 2024, , -.
10.1080/09603123.2024.2395437
2023
27. Kaya, H.; Ersoy, L.; ülger, M.; Bozok, T.; Aslan, G. Investigation of efflux pump genes in isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis isolates. INDIAN JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY, 2023, 46, 100428-.
10.1016/j.ijmmb.2023.100428
26. Gonca, S.; Polat, B.; özay, Y.; özdemir, S.; Küçükkara, .; Atmaca, H.; Dizge, N. Investigation of diode laser effect on the inactivation of selected Gram-negative bacteria, Gram-positive bacteria and yeast and its disinfection on wastewater and natural milk. ENVIRONMENTAL TECHNOLOGY, 2023, 44, 1238-1250.
10.1080/09593330.2021.2000036
25. Saleh, L.; Altıntaş, B.; Filiciotto, L.; Zorlu, Y.; Luque, R.; ülger, M.; Döndaş, H.; Altug, C. Structural assessment of novel spiro-naphthalene-1.2'-[1,3,4]oxadiazol-4-ones prepared under batch and flow chemistry with a concise antifungal and anti(myco)bacterial activity. TETRAHEDRON, 2023, 131, 133231-133231.https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S0040402022007554?token=74FBE2A44DA9DC38832A66CEAD47E264B9E6A5296F5CA83E7A83B708E9231706B338223346B68D05D250B137D357FDC8&originRegion=eu-west-1&originCreation=20230417074735://
24. Poyraz, S.; Dondas, H.; Sansano, J.; Belveren, S.; Yamalı, C.; Ulger, M.; Yaktubay dondas, N.; Saglık, B.; Pask, C. N-Benzoylthiourea-pyrrolidine carboxylic acid derivatives bearing an imidazole moiety: Synthesis, characterization, crystal structure, in vitro ChEs inhibition, and antituberculosis, antibacterial, antifungal studies. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE, 2023, 1273, 134303-134303.https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S0022286022019536?token=E3C74FA45C869E6F375F33ECA733A8521FB75FBA006886BFEAC011C88F7C2F0EDD8E53DE5882D6291282D642C7D72EAD&originRegion=eu-west-1&originCreation=20230417071905
23. Erdoğan eliuz, E.; Everest, Z.; Serin, M. Antimicrobial activity of Stachys rupestris Montbret et Aucher ex Benth. and inactivation of the pathogens inoculated on lab-made skin by the essential oil. INFORMA UK LIMITED, 2023, 33, 1749-1759.
10.1080/09603123.2022.2123457
22. Eroğlu, P.; Civaner, M.; Doğan çalhan, S.; ülger, M.; Binzet, R. Potential Biochemical Properties of Endemic Onosma mutabilis. ACTA CHIMICA SLOVENICA, 2023, 70, 196-203.
10.17344/acsi.2023.7998
21. özgür, D.; Ersoy, L.; ülger, M.; Tezcan ülger, S.; Aslan, G. Birinci Seçenek Antitüberküloz İlaçlara ve Verapamil Kombinasyonuna Maruz Bırakılan Dirençli Mycobacterium tuberculosis Kompleks Klinik İzolatlarındaki Efluks Pompa Genlerinin Araştırılması. MIKROBIYOL BUL, 2023, 57, 207-219.http://www.mikrobiyolbul.org/managete/fu_folder/2023-02/207-219%20(3)%20Didem%20Ozgur.pdf
20. Yalçın özkat, G.; Ersan, R.; ülger, M.; Tezcan ülger, S.; Burmaoğlu, S.; Yıldız, .; Algül, . Design, synthesis, and computational studies of benzimidazole derivatives as new antitubercular agents. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE AND DYNAMICS, 2023, 41, 2667-2686.Publications_038.pdf
19. Harmandar, K.; Gonca, S.; Küçük, T.; Günay, A.; Atilla, D.; özdemir, S.; Gürek, A. Zn(II) phthalocyanines having fluoroether groups: Synthesis, characterization, photo-physicochemical and biological properties. WORLD SCIENTIFIC PUB CO PTE LTD, 2023, 27, 340-349.
10.1142/S1088424622501000
18. Yaşar, N.; Tezcan ülger, S.; ülger, M.; Arslantürk, A.; Aslan, G.; Köksal, F. Etambutole Dirençli ve Duyarlı Mycobacterium tuberculosis Kompleksi Klinik İzolatlarında embA, embB ve embC Gen Bölgesi Mutasyonları. MIKROBIYOL BUL, 2023, 57, 45-59.http://www.mikrobiyolbul.org/managete/fu_folder/2023-01/45-59%20Seda%20Tezcan%20Ulger.pdf
17. Eskikaya, B.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Balakrishnan, D.; Shaik, F.; Senthilkumar, N. A comparative study of iron nanoflower and nanocube in terms of antibacterial properties. APPLIED NANOSCIENCE, 2023, 13, 5421-5433.
10.1007/s13204-023-02822-5
16. Yamalı, C.; Sevin, S.; Nenni, M.; Tuğrak sakarya, M.; Uyar, R.; Aygül, A.; ülger, M.; Ilhan, R.; Levent, S. Design, synthesis, and assessment of pharmacological properties of indole-based fluorinated chalcones and their benzenesulfonamide analogs. CHAMICAL PAPERS, 2023, 77, 7903-7918.
10.1007/s11696-023-03060-3
15. Yefimova, S.; Klochkov, V.; Kavok, N.; Tkachenko, A.; Onishchenko, A.; Chumachenko, T.; Dizge, N.; özdemir, S.; Gonca, S. Antimicrobial activity and cytotoxicity study of cerium oxide nanoparticles with two different sizes. WILEY, 2023, 111, 872-880.
10.1002/jbm.b.35197
14. Poyraz, S.; Döndaş, H.; Sansano, J.; Belveren, S.; Yamalı, C.; ülger, M.; Döndaş, N.; Sağlık, B.; Pask, C. N-Benzoylthiourea-pyrrolidine carboxylic acid derivatives bearing an imidazole moiety: Synthesis, characterization, crystal structure, in vitro ChEs inhibition, and antituberculosis, antibacterial, antifungal studies. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE, 2023, 1273, -.
10.1016/j.molstruc.2022.134303
13. Saleh, M.; ışık, Z.; Belibagli, P.; Arslan, H.; Gonca, S.; özdemir, S.; Kudaibergenov, N.; Khataee, A.; Dizge, N. Fabrication of Ag nanoparticles coated leonardite basalt ceramic membrane with improved antimicrobial properties for DNA cleavage, E. coli removal and antibiofilm effects. JOURNAL OF INDUSTRIAL AND ENGINEERING CHEMISTRY, 2023, 128, -.
10.1016/j.jiec.2023.08.018
12. Barçın, T.; Haj ersan, R.; Alagöz, M.; Döğen, A.; Burmaoglu, S.; Algül, . Deep learning approach to the discovery of novel bisbenzazole derivatives for antimicrobial effect. ELSEVIER BV, 2023, 1295, -.
10.1016/j.molstruc.2023.136668
11. öksüz, Z.; Gragnani, L.; Lorini, S.; Temel, G.; Serin, M.; Zignego, A. Evaluation of Plasma miR-17-5p, miR-24-3p and miRNA-223-3p Profile of Hepatitis C Virus-Infected Patients after Treatment with Direct-Acting Antivirals. MDPI AG, 2023, 13, -.
10.3390/jpm13081188
10. Saleh, L.; Altıntaş, B.; Filiciotto, L.; Zorlu, Y.; Luque, R.; ülger, M.; Döndaş, H.; Altuğ, C. Structural assessment of novel spiro-naphthalene-1.2- [1,3,4]oxadiazol-4-ones prepared under batch and flow chemistry with a concise antifungal and anti(myco)bacterial activity. TETRAHEDRON, 2023, 131, -.
10.1016/j.tet.2022.133231
9. Turabik, M.; özdemir, S.; Akinbingol, G.; Gonca, S.; Geçgel, C. Comparison of antioxidant, antimicrobial, DNA cleavage, cell viability, and biofilm inhibition activities of mono- and bimetallic copper and zinc nanoparticles. ELSEVIER BV, 2023, 155, -.
10.1016/j.inoche.2023.111072
8. Albayrak, S.; Farajzadeh, N.; Yenilmez, H.; özdemir, S.; Gonca, S.; Altuntaş bayır, Z. Fluorinated Phthalocyanine/Silver Nanoconjugates for Multifunctional Biological Applications. CHEMISTRY & BIODIVERSITY, 2023, 20, -.
10.1002/cbdv.202300389
7. Karimi, F.; Tiri, R.; Aygun, A.; Gulbagca, F.; özdemir, S.; Gonca, S.; Gür, T.; şen, F. One-step synthesized biogenic nanoparticles using Linum usitatissimum: Application of sun-light photocatalytic, biological activity and electrochemical H2O2 sensor. ELSEVIER BV, 2023, 218, -.
10.1016/j.envres.2022.114757
6. ısik, Z.; Bouchareb, R.; Arslan, H.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Balakrishnan, D.; Prasad, S. Green synthesis of iron oxide nanoparticles derived from water and methanol extract of Centaurea solstitialis leaves and tested for antimicrobial activity and dye decolorization capability. ELSEVIER BV, 2023, 219, -.
10.1016/j.envres.2022.115072
5. Bouras, H.; Bouras, N.; Alterkaoui, A.; ısik, Z.; Gonca, S.; özdemir, S.; Dizge, N. Biosynthesis of Silver Nanoparticles Using Saccharothrix algeriensis and Preparation of Antifouling PES Membranes. WATER AIR SOIL POLLUT, 2023, 234, -.
10.1007/s11270-023-06465-8
4. Turunç, E.; Karaman, O.; Döğen, A.; Binzet, R. Green synthesis of graphene quantum dot- and its electrochemical, antioxidant and antimicrobial activities. ELSEVIER BV, 2023, 299, -.
10.1016/j.synthmet.2023.117453
3. Metin, D.; Hilmioğlu polat, S.; Döğen, A.; Palamar onay, M. Fungal Keratitis and Corneal Perforation as a Rare Complication of Corneal Collagen Cross-Linking Treatment. OVID TECHNOLOGIES (WOLTERS KLUWER HEALTH), 2023, 42, -.
10.1097/ICO.0000000000003270
2. ünal, N.; Karaman, O.; Döğen, A.; Binzet, R. Investigation of the Chemical Composition, Antimicrobial, and Antioxidant Activity of Endemic Onosma halophila Boiss. & Heldr.. SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, 80, -.
10.1007/s00284-023-03363-4
1. özay, Y.; Alterkaoui, A.; Kahya, K.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Ocakoğlu, K.; Külekci, M. Antifouling and antibacterial performance evaluation of polyethersulfone membranes modified with AZ63 alloy. IWA PUBLISHING, 2023, 87, -.
10.2166/wst.2022.396