Farmasötik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı

Farmasötik Mikrobiyoloji, insanlarda enfeksiyona neden olan mikroorganizmaların özelliklerini, bu mikroorganizmaların neden olduğu hastalıkları ve bu hastalıkların tanısında kullanılan mikrobiyolojik yöntemleri inceler. Ayrıca antimikrobiyal ajanlar ve mikrobiyal kaynaklı ürünlerin üretimi, kozmetik ve farmasötiklerde mikrobiyolojik kalite kontrol prosedürleri, sterilizasyon-dezenfeksiyon yöntemleri ve genel hijyen gibi konular da Farmasotik Mikrobiyoloji’nin ilgi alanına girer. Anabilim dalımız interdisipliner bir bilim dalı olan Farmasötik Mikrobiyoloji alanındaki temel kavramları özümsemis ve bunları mesleğin her alanında uygulama yeteneğine sahip olan eczacılar, temel bilimciler ve araştırmacılar yetiştirmeyi amaç edinmiştir. Bunun yanı sıra, Anabilim Dalımız, Farmasötik Mikrobiyoloji ve Tıbbi Mikrobiyoloji alanındaki gelişmeleri yakından takip ederek toplum sağlığına hizmet eden güncel araştırmalar yapmayı ve edindiği bilgi birikimini ulusal ve uluslararası platformda öğrencilere, bilim dünyasına, endüstriye ve topluma en etkin şekilde aktarmayı hedeflemektedir.
Anabilim Dalı Olanakları
FARMASÖTİK MİKROBİYOLOJİ YÜKSEK LİSANS PROGRAMI
Biten Tezler:
1-Danışman: Doç. Dr. Aylin DÖĞEN
Yüksek Lisans Öğrencisi: Müge ARIBAL ÇELİK
Tez Başlığı: Candida albicans’ın Eşey Tipi Gen Bölgesi Karakterizasyonunun Belirlenmesi
Tez Savunma Sınav Tarihi: 19.04.2019
2- Danışman: Doç. Dr. Aylin DÖĞEN
Yüksek Lisans Öğrencisi: Deniz AKTAŞ
Tez Başlığı: Çevresel Örneklerde Cryptococcus Türlerinin Araştırılması ve Eşey Tipinin Belirlenmesi
Tez Savunma Sınav Tarihi: 15.11.2019
3- Danışman: Dr. Öğr. Üyesi Mahmut ÜLGER
Yüksek Lisans Öğrencisi: Nurcihan BİLTEKİN
Tez Başlığı: Bir Üniversite Hastanesinde Tüberkülozlu Hastalardan İzole Edilen Mycobacterium tuberculosis Kompleks İzolatlarının Moleküler Yöntemler ile Genotiplendirilmesi
Tez Savunma Sınav Tarihi: 28.11.2019
4- Danışman: Dr. Öğr. Üyesi Mahmut ÜLGER
Yüksek Lisans Öğrencisi: Doğan Can ARLAN
Tez Başlığı: Tüberküloz Hastalarında FokI ve TaqI Vitamin D Reseptörü Polimorfizmlerinin Araştırılması
Tez Savunma Sınav Tarihi: 18.01.2021
5- Danışman: Dr. Öğr. Üyesi Mahmut ÜLGER
Yüksek Lisans Öğrencisi: Tolga TOROL
Tez Başlığı: Klinik Örneklerden İzole Edilen Enterobacteriaceae İzolatlarında Plazmid Aracılı Kolistin Direncinin Moleküler Yöntemler ile Araştırılması.
Tez Savunma Sınav Tarihi: 18.01.2021
6- Danışman: Dr. Öğr. Üyesi Mahmut ÜLGER
Yüksek Lisans Öğrencisi: Tolga TOROL
Tez Başlığı: Klinik Örneklerden İzole Edilen Enterobacteriaceae İzolatlarında Plazmid Aracılı Kolistin Direncinin Moleküler Yöntemler ile Araştırılması.
Tez Savunma Sınav Tarihi: 18.01.2021
Seminerler:
1-Danışman: Dr. Öğr. Üyesi Mahmut ÜLGER
Yüksek Lisans Öğrencisi: Doğan Can ASLAN
Seminer Konusu: El Hijyeni ve El Yıkama Çeşitleri
Seminer Sunum Tarihi: 02.05.2019
2- Danışman: Prof. Dr. Mehmet Sami SERİN
Yüksek Lisans Öğrencisi: Seren OĞULTEKİN
Seminer Konusu: Virüslerin Genel Özellikleri
Seminer Sunum Tarihi: 05.05.2020
3- Danışman: Prof. Dr. Aylin DÖĞEN
Doktora Öğrencisi: Deniz AKTAŞ
Seminer Konusu: Cryptococcus
Seminer Sunum Tarihi: 08.05.2020
4-Danışman: Prof. Dr. Aylin DÖĞEN
Doktora Öğrencisi: Deniz AKTAŞ
Seminer Konusu Türkçe: Geçmişten Günümüze Aşılar
Seminer Sunum Tarihi: 22.12.2020
5-Danışman: Doç. Dr. Mahmut ÜLGER
Doktora Öğrencisi: Nurcihan BİLTEKİN
Seminer Konusu: Antibiyotik Kullanımı ve Antimikrobiyal Direnç
Seminer Sunum Tarihi:17.05.2022
6-Danışman: Prof. Dr. Aylin DÖĞEN
Yüksek Lisans Öğrencisi: Fatma ÜNLÜ
Seminer Konusu: Candida ve Kandidozlar
Seminer Sunum Tarihi:17.05.2022
7-Danışman:Doç. Dr. Serpil GONCA
Yüksek Lisans Öğrencisi: Semih DOĞAN
Seminer Konusu: Sterilizasyon ve Dezenfeksiyon Yöntemleri
Seminer Sunum Tarihi:17.05.2022
Son İki Yılda Uluslararası Dergilerde Yayınlanan Makaleler
2025
36. Oğultekin teneke, S.; Serin, M.; öksüz, Z.; Temel, G.; Yaraş, S.; üçbilek, E.; Sezgin, O. Circulating chemokine levels and receptor polymorphisms have potential as biomarkers for fibrosis stages in patients with chronic hepatitis C infection. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, 2025, 52, 12-.
10.1007/s11033-025-10244-5
2025
35. Alterkaoui, A.; Gonca, S.; Doğan, S.; ışık, Z.; özdemir, S.; Filiz, V.; Dizge, N. Preparation of Cobalt Oxide Powders Synthesized by Green Chemistry Method and Improving the Antibacterial Performance of PES Membrane. WATER, AIR, & SOIL POLLUTION, 2025, 236, -.
10.1007/s11270-025-07796-4
2024
34. Giray, G.; Gonca, S.; özdemir, S.; ışık, Z.; Yılmaz, E.; Soylak, M.; Dizge, N. Novel extracellular synthesized silver nanoparticles using thermophilic Anoxybacillus flavithermus and Geobacillus stearothermophilus and their evaluation as nanodrugs. PREPARATIVE BIOCHEMISTRY & BIOTECHNOLOGY, 2024, 54, 294-306.
10.1080/10826068.2023.2230496
33. ülger, M. Design, synthesis, biological evaluation and docking analysis of pyrrolidine-benzenesulfonamides as carbonic anhydrase or acetylcholinesterase inhibitors and antimicrobial agents. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, 2024, 42, 3441-3458.
10.1080/07391102.2023.2214224
32. AktaÅŸ, D.; Kaplan, E.; Ergin, Ã.; Ilkit, M.; Döğen, A. Çevresel Örneklerde Cryptococcus Kolonizasyonunun ve EÅŸey Genotipinin AraÅŸtırılması. MIKROBIYOLOJI BÃœLTENI, 2024, 58, 39-48.
10.5578/mb.20249904
31. ödemiÅŸ, Ã.; özdemir, S.; Gonca, S.; AğırtaÅŸ, M. Characterization of silver nanoparticles fabricated by green synthesis using Urtica dioica and Lavandula angustifolia and investigation of antimicrobial and antioxidant. INORGANIC AND NANO-METAL CHEMISTRY, 2024, 54, 429-442.
10.1080/24701556.2022.2068584
30. Koçak, Y.; Aygün, A.; Altuner, E.; özdemir, S.; Gonca, S.; Berikten, D.; Tiri, R.; şen, F. Eco-friendly production of platinum nanoparticles: physicochemical properties, evaluation of biological and catalytic activities. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2024, 21, 51-62.
10.1007/s13762-023-05232-w
29. Tiri, R.; Aygun, A.; Bekmezci, M.; Gonca, S.; özdemir, S.; Kaymak, G.; Karimi‑maleh, H.; şen, F. Environmental Energy Production and Wastewater Treatment Using Synthesized Pd Nanoparticles with Biological and Photocatalytic Activity. TOPICS IN CATALYSIS, 2024, 67, -.
10.1007/s11244-024-01912-0
28. Binzet, G.; Turunç, E.; Binzet, R.; Döğen, A.; Arslan, H. Chemical composition and antimicrobial activity of essential oils and various extracts of endemic Onosma malatyana (Boraginaceae) from Anatolia. INTERNATIONAL JOURNAL OF ENVIRONMENTAL HEALTH RESEARCH, 2024, , -.
10.1080/09603123.2024.2395437
2023
27. Kaya, H.; Ersoy, L.; ülger, M.; Bozok, T.; Aslan, G. Investigation of efflux pump genes in isoniazid resistant Mycobacterium tuberculosis isolates. INDIAN JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY, 2023, 46, 100428-.
10.1016/j.ijmmb.2023.100428
26. Gonca, S.; Polat, B.; özay, Y.; özdemir, S.; Küçükkara, Ä.; Atmaca, H.; Dizge, N. Investigation of diode laser effect on the inactivation of selected Gram-negative bacteria, Gram-positive bacteria and yeast and its disinfection on wastewater and natural milk. ENVIRONMENTAL TECHNOLOGY, 2023, 44, 1238-1250.
10.1080/09593330.2021.2000036
25. Saleh, L.; Altıntaş, B.; Filiciotto, L.; Zorlu, Y.; Luque, R.; ülger, M.; Döndaş, H.; Altug, C. Structural assessment of novel spiro-naphthalene-1.2'-[1,3,4]oxadiazol-4-ones prepared under batch and flow chemistry with a concise antifungal and anti(myco)bacterial activity. TETRAHEDRON, 2023, 131, 133231-133231.https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S0040402022007554?token=74FBE2A44DA9DC38832A66CEAD47E264B9E6A5296F5CA83E7A83B708E9231706B338223346B68D05D250B137D357FDC8&originRegion=eu-west-1&originCreation=20230417074735://
24. Poyraz, S.; Dondas, H.; Sansano, J.; Belveren, S.; Yamalı, C.; Ulger, M.; Yaktubay dondas, N.; Saglık, B.; Pask, C. N-Benzoylthiourea-pyrrolidine carboxylic acid derivatives bearing an imidazole moiety: Synthesis, characterization, crystal structure, in vitro ChEs inhibition, and antituberculosis, antibacterial, antifungal studies. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE, 2023, 1273, 134303-134303.https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S0022286022019536?token=E3C74FA45C869E6F375F33ECA733A8521FB75FBA006886BFEAC011C88F7C2F0EDD8E53DE5882D6291282D642C7D72EAD&originRegion=eu-west-1&originCreation=20230417071905
23. ErdoÄŸan eliuz, E.; Everest, Z.; Serin, M. Antimicrobial activity of Stachys rupestris Montbret et Aucher ex Benth. and inactivation of the pathogens inoculated on lab-made skin by the essential oil. INFORMA UK LIMITED, 2023, 33, 1749-1759.
10.1080/09603123.2022.2123457
22. Eroğlu, P.; Civaner, M.; Doğan çalhan, S.; ülger, M.; Binzet, R. Potential Biochemical Properties of Endemic Onosma mutabilis. ACTA CHIMICA SLOVENICA, 2023, 70, 196-203.
10.17344/acsi.2023.7998
21. özgür, D.; Ersoy, L.; ülger, M.; Tezcan ülger, S.; Aslan, G. Birinci Seçenek Antitüberküloz İlaçlara ve Verapamil Kombinasyonuna Maruz Bırakılan Dirençli Mycobacterium tuberculosis Kompleks Klinik İzolatlarındaki Efluks Pompa Genlerinin Araştırılması. MIKROBIYOL BUL, 2023, 57, 207-219.http://www.mikrobiyolbul.org/managete/fu_folder/2023-02/207-219%20(3)%20Didem%20Ozgur.pdf
20. Yalçın özkat, G.; Ersan, R.; ülger, M.; Tezcan ülger, S.; BurmaoÄŸlu, S.; Yıldız, Ä.; Algül, Ã. Design, synthesis, and computational studies of benzimidazole derivatives as new antitubercular agents. JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE AND DYNAMICS, 2023, 41, 2667-2686.Publications_038.pdf
19. Harmandar, K.; Gonca, S.; Küçük, T.; Günay, A.; Atilla, D.; özdemir, S.; Gürek, A. Zn(II) phthalocyanines having fluoroether groups: Synthesis, characterization, photo-physicochemical and biological properties. WORLD SCIENTIFIC PUB CO PTE LTD, 2023, 27, 340-349.
10.1142/S1088424622501000
18. Yaşar, N.; Tezcan ülger, S.; ülger, M.; Arslantürk, A.; Aslan, G.; Köksal, F. Etambutole Dirençli ve Duyarlı Mycobacterium tuberculosis Kompleksi Klinik İzolatlarında embA, embB ve embC Gen Bölgesi Mutasyonları. MIKROBIYOL BUL, 2023, 57, 45-59.http://www.mikrobiyolbul.org/managete/fu_folder/2023-01/45-59%20Seda%20Tezcan%20Ulger.pdf
17. Eskikaya, B.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Balakrishnan, D.; Shaik, F.; Senthilkumar, N. A comparative study of iron nanoflower and nanocube in terms of antibacterial properties. APPLIED NANOSCIENCE, 2023, 13, 5421-5433.
10.1007/s13204-023-02822-5
16. Yamalı, C.; Sevin, S.; Nenni, M.; Tuğrak sakarya, M.; Uyar, R.; Aygül, A.; ülger, M.; Ilhan, R.; Levent, S. Design, synthesis, and assessment of pharmacological properties of indole-based fluorinated chalcones and their benzenesulfonamide analogs. CHAMICAL PAPERS, 2023, 77, 7903-7918.
10.1007/s11696-023-03060-3
15. Yefimova, S.; Klochkov, V.; Kavok, N.; Tkachenko, A.; Onishchenko, A.; Chumachenko, T.; Dizge, N.; özdemir, S.; Gonca, S. Antimicrobial activity and cytotoxicity study of cerium oxide nanoparticles with two different sizes. WILEY, 2023, 111, 872-880.
10.1002/jbm.b.35197
14. Poyraz, S.; Döndaş, H.; Sansano, J.; Belveren, S.; Yamalı, C.; ülger, M.; Döndaş, N.; Sağlık, B.; Pask, C. N-Benzoylthiourea-pyrrolidine carboxylic acid derivatives bearing an imidazole moiety: Synthesis, characterization, crystal structure, in vitro ChEs inhibition, and antituberculosis, antibacterial, antifungal studies. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE, 2023, 1273, -.
10.1016/j.molstruc.2022.134303
13. Saleh, M.; ışık, Z.; Belibagli, P.; Arslan, H.; Gonca, S.; özdemir, S.; Kudaibergenov, N.; Khataee, A.; Dizge, N. Fabrication of Ag nanoparticles coated leonardite basalt ceramic membrane with improved antimicrobial properties for DNA cleavage, E. coli removal and antibiofilm effects. JOURNAL OF INDUSTRIAL AND ENGINEERING CHEMISTRY, 2023, 128, -.
10.1016/j.jiec.2023.08.018
12. Barçın, T.; Haj ersan, R.; Alagöz, M.; Döğen, A.; Burmaoglu, S.; Algül, Ã. Deep learning approach to the discovery of novel bisbenzazole derivatives for antimicrobial effect. ELSEVIER BV, 2023, 1295, -.
10.1016/j.molstruc.2023.136668
11. öksüz, Z.; Gragnani, L.; Lorini, S.; Temel, G.; Serin, M.; Zignego, A. Evaluation of Plasma miR-17-5p, miR-24-3p and miRNA-223-3p Profile of Hepatitis C Virus-Infected Patients after Treatment with Direct-Acting Antivirals. MDPI AG, 2023, 13, -.
10.3390/jpm13081188
10. Saleh, L.; Altıntaş, B.; Filiciotto, L.; Zorlu, Y.; Luque, R.; ülger, M.; Döndaş, H.; Altuğ, C. Structural assessment of novel spiro-naphthalene-1.2- [1,3,4]oxadiazol-4-ones prepared under batch and flow chemistry with a concise antifungal and anti(myco)bacterial activity. TETRAHEDRON, 2023, 131, -.
10.1016/j.tet.2022.133231
9. Turabik, M.; özdemir, S.; Akinbingol, G.; Gonca, S.; Geçgel, C. Comparison of antioxidant, antimicrobial, DNA cleavage, cell viability, and biofilm inhibition activities of mono- and bimetallic copper and zinc nanoparticles. ELSEVIER BV, 2023, 155, -.
10.1016/j.inoche.2023.111072
8. Albayrak, S.; Farajzadeh, N.; Yenilmez, H.; özdemir, S.; Gonca, S.; Altuntaş bayır, Z. Fluorinated Phthalocyanine/Silver Nanoconjugates for Multifunctional Biological Applications. CHEMISTRY & BIODIVERSITY, 2023, 20, -.
10.1002/cbdv.202300389
7. Karimi, F.; Tiri, R.; Aygun, A.; Gulbagca, F.; özdemir, S.; Gonca, S.; Gür, T.; şen, F. One-step synthesized biogenic nanoparticles using Linum usitatissimum: Application of sun-light photocatalytic, biological activity and electrochemical H2O2 sensor. ELSEVIER BV, 2023, 218, -.
10.1016/j.envres.2022.114757
6. ısik, Z.; Bouchareb, R.; Arslan, H.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Balakrishnan, D.; Prasad, S. Green synthesis of iron oxide nanoparticles derived from water and methanol extract of Centaurea solstitialis leaves and tested for antimicrobial activity and dye decolorization capability. ELSEVIER BV, 2023, 219, -.
10.1016/j.envres.2022.115072
5. Bouras, H.; Bouras, N.; Alterkaoui, A.; ısik, Z.; Gonca, S.; özdemir, S.; Dizge, N. Biosynthesis of Silver Nanoparticles Using Saccharothrix algeriensis and Preparation of Antifouling PES Membranes. WATER AIR SOIL POLLUT, 2023, 234, -.
10.1007/s11270-023-06465-8
4. Turunç, E.; Karaman, O.; Döğen, A.; Binzet, R. Green synthesis of graphene quantum dot- and its electrochemical, antioxidant and antimicrobial activities. ELSEVIER BV, 2023, 299, -.
10.1016/j.synthmet.2023.117453
3. Metin, D.; Hilmioğlu polat, S.; Döğen, A.; Palamar onay, M. Fungal Keratitis and Corneal Perforation as a Rare Complication of Corneal Collagen Cross-Linking Treatment. OVID TECHNOLOGIES (WOLTERS KLUWER HEALTH), 2023, 42, -.
10.1097/ICO.0000000000003270
2. ünal, N.; Karaman, O.; Döğen, A.; Binzet, R. Investigation of the Chemical Composition, Antimicrobial, and Antioxidant Activity of Endemic Onosma halophila Boiss. & Heldr.. SPRINGER SCIENCE AND BUSINESS MEDIA LLC, 2023, 80, -.
10.1007/s00284-023-03363-4
1. özay, Y.; Alterkaoui, A.; Kahya, K.; özdemir, S.; Gonca, S.; Dizge, N.; Ocakoğlu, K.; Külekci, M. Antifouling and antibacterial performance evaluation of polyethersulfone membranes modified with AZ63 alloy. IWA PUBLISHING, 2023, 87, -.
10.2166/wst.2022.396