Polimer filmler, fiberler, su, proteinler, düsük molekül kütleli hidrokarbonlar, tarım, gıda ve petrol ürünleri gibi birçok maddenin analizinde kullanılır. FT-IR molekül yapı ve etkilesimlerinin incelenmesinde de kullanılmaktadır. Kimya, eczacılık, biyoloji, gıda, jeoloji ve çevre gibi birçok alanda yapılan çalısmalarda kullanılan bir cihazdır.