Mersin Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü’nün stratejik hedefleri;

1)    Eğitim programlarını çeşitlendirmek

2)    Eğitim programlarının müfredatlarını iyileştirmek

3)    Disiplinlerarası programların açılmasını sağlamak

4)    Yaygın etkisi yüksek araştırma sayısını artırmak

5)    Tezlerden üretilen yayın sayısını artırmak

6)    Proje desteği veren kurum ve kuruluşlarla işbirliği yapmak

7)    Uluslararası işbirliklerini artırmak